El Departamento de Orientación Integral está formado por pastores, psicólogos, psicopedagogos, counselors y consejeros.

Su tarea sirve al alumnado, al personal de la institución, familiares, e inclusive a personas de la comunidad que requieran sus servicios.

Coordina asimismo actividades propias y de ministerios de la Iglesia Transparente, organizando eventos que apunten a la formación integral de los alumnos.